Nato nel 1939 a Raba Wyżna. Nel 2005 e nominato arcivescovo metropolita di Cracovia da Benedetto XVI.
Ha conseguto il dottorato di ricerca in Teologia e la laurea honoris causa dell'Universita Cattolica di Lublino, dell'Accademia Pedagogica di Cracovia, dell'Universita Abat Oliba CEU di Barcellona, dell'Universita di Varmia e Masuria. Per motli anni e stato segretario e amico di Papa Giovanni Paolo II.
Nel 1963 l'allora vescovo Karol Wojtyła gli conferi gli ordini sacerdotali nella cattedrale di Wawel.
Quando Karol Wojtyła fu consacrato cardinale, Stanisław Dziwisz svolse al suo fianco la funzione di cappellano.
Come cappellano ha partecipato in modo attivo alla vita della Curia e ha insegnato Liturgia all'Istituto per la Catechesi di Cracovia. Nel 1978 e stato nominato segretario personale del Papa Giovanni Paolo II in Vaticano.
Ha svolto questa funzione fino alla morte del Santo Padre nel 2005.
Il tempo trascorso a fianco del Papa e stato la base per il libro Una vita con Karol, un'intervista-fiume scritta dal giornalista italiano Gian Franco Svidercoschi.